加州大學(xué)圣克魯茲分校的研究人員在人類RNA中發(fā)現(xiàn)了一種調(diào)節(jié)炎癥的肽，這可能為治療關(guān)節(jié)炎和狼瘡等疾病提供新的途徑。該團(tuán)隊使用基于強(qiáng)大的基因編輯工具CRISPR的篩選過程，揭示了關(guān)于我們rna的最大謎團(tuán)之一-負(fù)責(zé)執(zhí)行我們DNA中包含的遺傳信息的分子。
這種肽起源于一種叫做LOUP的長鏈非編碼RNA (lncRNA)。據(jù)研究人員稱，人類基因組編碼超過20,000個lncrna，使其成為基因組產(chǎn)生的最大基因群。但盡管如此，科學(xué)家們對lncrna存在的原因以及它們的作用知之甚少。這就是為什么lncRNA有時被稱為“基因組的暗物質(zhì)”。
這項研究發(fā)表在5月23日的《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)上，是現(xiàn)有文獻(xiàn)中為數(shù)不多的揭示lncRNA奧秘的研究之一。這也為快速鑒定免疫細(xì)胞中功能性lncrna提供了一種高通量篩選的新策略。混合篩選方法允許研究人員在一次實驗中針對數(shù)千個基因，這是一種比傳統(tǒng)實驗更有效的研究基因組未表征部分的方法，而傳統(tǒng)實驗一次只關(guān)注一個基因。
這項研究是由免疫學(xué)家Susan Carpenter領(lǐng)導(dǎo)的，她是加州大學(xué)圣克魯茲分校分子、細(xì)胞和發(fā)育生物系的教授和Sinsheimer主席。她研究預(yù)防感染的分子機(jī)制。具體來說，她專注于導(dǎo)致炎癥的過程，以確定lncrna在這些途徑中發(fā)揮的作用。
“炎癥是幾乎所有疾病的核心特征，在這項研究中，我的實驗室專注于試圖確定哪些lncRNA基因參與調(diào)節(jié)炎癥。”
這意味著研究一種被稱為單核細(xì)胞的白細(xì)胞中的lncrna。他們使用CRISPR/Cas9技術(shù)的一種修改，稱為CRISPR抑制(CRISPRi)，來抑制基因轉(zhuǎn)錄，并找出單核細(xì)胞的lncrna中哪一種在它是否分化為巨噬細(xì)胞中起作用，巨噬細(xì)胞是另一種白細(xì)胞，對功能良好的免疫反應(yīng)至關(guān)重要。
此外，研究人員使用CRISPRi篩選巨噬細(xì)胞lncRNA參與炎癥。出乎意料的是，他們發(fā)現(xiàn)了一個多功能區(qū)域，既可以作為RNA工作，也可以包含一種未被發(fā)現(xiàn)的調(diào)節(jié)炎癥的肽。
Susan Carpenter說，了解了這種特殊的肽調(diào)節(jié)炎癥，制藥商就有了一個目標(biāo)，可以阻斷反應(yīng)背后的分子相互作用，從而抑制炎癥。“在理想情況下，你可以設(shè)計一個小分子來破壞這種特定的相互作用，而不是瞄準(zhǔn)一種可能在全身表達(dá)的蛋白質(zhì)，”她解釋說。“我們距離精確定位這些通路還有很長的路要走，但這絕對是我們的目標(biāo)?，F(xiàn)在人們對RNA療法很感興趣。”
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2024-5/20240525052140129.htm）
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