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科普 | 肺癌甲基化在早期肺癌診斷中的應(yīng)用
[ 發(fā)布日期:2023-12-14 11:30:48    閱讀次數(shù):501 ]

據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),肺癌是全球癌癥死亡的首要原因,發(fā)病率為11.4%,死亡率為18.0%。在中國(guó),肺癌在惡性腫瘤中發(fā)病率最高。肺腺癌(LUAD)是非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)最常見(jiàn)的組織學(xué)亞型,約占肺癌病例的40%。早期非小細(xì)胞肺癌的手術(shù)切除提供了良好的預(yù)后,5年生存率為70-90%(I期),而大多數(shù)患者(約75%)在診斷時(shí)已是晚期(III/IV期)并且他們的存活率很低。


隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,在各種腫瘤中發(fā)現(xiàn)了異常的DNA甲基化模式,并被認(rèn)為是癌癥的重要原因。甲基化通常存在于高度和中度重復(fù)的DNA序列中,并在染色體不穩(wěn)定性中起關(guān)鍵作用。腫瘤抑制基因的啟動(dòng)子高甲基化通常與基因沉默有關(guān)。DNA甲基化在癌癥發(fā)生的早期階段參與腫瘤形成。此外,DNA甲基化隨著時(shí)間的推移相對(duì)穩(wěn)定,可以在血液、尿液、唾液和其他體液中非侵入性地檢測(cè)到。因此,越來(lái)越多的甲基化生物標(biāo)志物被開(kāi)發(fā)用于腫瘤的早期篩查和診斷。國(guó)內(nèi)相關(guān)研究顯示[1],在肺泡灌洗液中聯(lián)合SHOX2和RASSF1A甲基化檢測(cè)對(duì)肺癌的總體診斷效率顯著高于細(xì)胞學(xué)檢查和血清生物標(biāo)志物癌胚抗原。另一項(xiàng)研究顯示上述兩基因甲基化PCR聯(lián)合檢測(cè)時(shí),任一陽(yáng)性者肺腺癌、鱗癌檢出率分別達(dá)到66.0%和90.9%。提示SHOX2和RASSF1A甲基化檢測(cè)在肺癌早期診斷時(shí)的巨大價(jià)值。

 

01

RASSF1A基因功能與疾病



RAS-關(guān)聯(lián)結(jié)構(gòu)域家族(RASSF)由從RASSF1到RASSF10的10個(gè)成員組成。這些蛋白質(zhì)的特征一般認(rèn)為在于Ras關(guān)聯(lián)(RA)結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域可以在C末端(例如RASSF16,稱為C-RASSF蛋白質(zhì))或N末端(例如RASSF7-10,稱為N-RASSF蛋白質(zhì))上發(fā)現(xiàn)。RASSF1和RASSF5是該蛋白家族中被廣泛和顯著研究的成員,而很少有研究提供關(guān)于其他成員的數(shù)據(jù)。

 

RASSF1A和RASSF1C在正常組織中普遍表達(dá),它們位于微管并參與生長(zhǎng)調(diào)節(jié)。二者在癌癥中的作用幾乎相反,前者起到抑制癌癥的作用,后者則在致癌過(guò)程中起著舉足輕重的作用。RASSF1A的高甲基化轉(zhuǎn)錄沉默打破了兩者的平衡,導(dǎo)致RASSF1C的過(guò)度表達(dá)和引導(dǎo)RASSF1C在癌癥發(fā)生中發(fā)揮功能。根據(jù)相關(guān)數(shù)據(jù),RASSFIA啟動(dòng)子甲基化在肺癌中的頻率高達(dá)88%,而在正常的周圍組織中幾乎沒(méi)有甲基化,RASSF1A啟動(dòng)子甲基化的頻率在小細(xì)胞肺癌(SCLC)中幾乎達(dá)到100%,在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中達(dá)到65%。


02

SHOX2基因功能與疾病



 

SHOX蛋白主要分布在四肢骨骼、心臟、鼻、鰓弓、神經(jīng)系統(tǒng)和人類胚胎生殖結(jié)節(jié)的中段和相對(duì)遠(yuǎn)端。SHOX2相對(duì)靠近四肢。此外,SHOX2也表達(dá)于鼻突中樞神經(jīng)系統(tǒng)基板、背根神經(jīng)節(jié)、心臟流入道、第三咽弓和衍生結(jié)構(gòu)。SHOX基因主要調(diào)節(jié)早期胚胎身體結(jié)構(gòu)和心臟自主節(jié)律系統(tǒng)的發(fā)育。SHOX基因的突變,通常會(huì)導(dǎo)致表達(dá)缺失,可能導(dǎo)致身材矮小綜合征。

 

SHOX2通過(guò)增加RUNX2抑制p53的活性來(lái)抑制抗凋亡和激活NF-kB通路,從而導(dǎo)致致癌生物過(guò)程的發(fā)生。

 

RASSF1A是Hippo途徑的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,并將該途徑與TNF-α、NF-kB和TGF-β信號(hào)傳導(dǎo)途徑偶聯(lián)。在炎性細(xì)胞因子、P53和K-RAS的協(xié)同作用下,RASSF1A的表觀遺傳性缺失連接了一系列重要的癌癥信號(hào)通路,并在癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移中起重要作用。SHOX2由于其與某些微小RNA的復(fù)雜關(guān)系,可能與Hippo、EMT、RAS/ ERK MAPK和PI3K/AKT通路交互,這些通路對(duì)腫瘤發(fā)生、轉(zhuǎn)移和肺癌的發(fā)生至關(guān)重要。

 

SHOX2能夠與TGF受體結(jié)合,并與NF-kB通路交互,表明與RASSF1A存在相互調(diào)節(jié)關(guān)系[2]。


03

SHOX2和RASSF1A甲基化在臨床研究中表現(xiàn)出良好的靈敏度和特異性



 

對(duì)來(lái)自南京鼓樓醫(yī)院54名早期LUAD患者和31名良性肺結(jié)節(jié)患者的樣品進(jìn)行聯(lián)合SHOX2和RASSF1A啟動(dòng)子甲基化測(cè)定。結(jié)果顯示:來(lái)自LUAD患者的腫瘤樣本SHOX2啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)水平略高于RASSF1A,同時(shí)發(fā)現(xiàn)SHOX2或者RASSF1A啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)對(duì)早期LUAD敏感且特異,但單個(gè)基因甲基化檢測(cè)的診斷效率不高。聯(lián)合啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)對(duì)0期患者的診斷潛力仍不清楚。隨著疾病分期從0-II期增加,或者隨著LUAD從AIS(原位癌)進(jìn)展到MIA(微浸潤(rùn)肺腺癌)再到IPA(浸潤(rùn)性腺癌),SHOX2或者RASSF1A啟動(dòng)子甲基化水平逐漸增加。聯(lián)合甲基化檢測(cè)呈陽(yáng)性的患者腫瘤可能發(fā)生快速進(jìn)展,需要積極治療。此外,對(duì)TCGA隊(duì)列的分析表明SHOX2在第三至第四階段沒(méi)有顯著上升。這可能表明SHOX2啟動(dòng)子高甲基化是早期LUAD的生物標(biāo)志物,但不是晚期LUAD的生物標(biāo)志物[3]。


TCGA隊(duì)列的I-IV期的正常樣品和腫瘤樣品之間甲基化比較


同濟(jì)大學(xué)同濟(jì)醫(yī)院對(duì)251例患者的FFPE切除標(biāo)本進(jìn)行SHOX2和RASSF1A甲基化水平檢測(cè)。其中確診為肺癌137例,其中腺癌70例,鱗癌51例,小細(xì)胞肺癌16例。另114例為良性疾病作為對(duì)照。同時(shí)對(duì)來(lái)自肺癌患者的17個(gè)穿刺活檢標(biāo)本進(jìn)行了分析。對(duì)于所有樣本,分析了與病理學(xué)確定的組織學(xué)分類和腫瘤分期相關(guān)的臨床表現(xiàn)。

 

圖片

 

SHOX2和RASSF1A不同組織學(xué)亞型組和腫瘤分期組中的甲基化

 

在小細(xì)胞肺癌、鱗癌、腺癌和總癌中的陽(yáng)性檢出率分別為100.0%、96.1%、82.9%和89.8%。在對(duì)照組中,114例良性肺部疾病患者中有11例檢測(cè)到SHOX2或RASSF1A陽(yáng)性,特異性為90.4%。單獨(dú)SHOX2檢測(cè)SCC的靈敏度為94.1%。結(jié)合RASSF1A,腺癌和小細(xì)胞肺癌的檢出率分別從64.3%和87.5%提高到82.9%和100%。SHOX2僅在l期腺癌中觀察到較低的敏感性。研究還發(fā)現(xiàn)SHOX2甲基化程度與肺癌的分期相關(guān),由l期到IV期不斷加深,而RASSF1A甲基化在肺癌的病例中沒(méi)有觀察到這種相關(guān)性。另外17個(gè)穿刺活檢標(biāo)本中,高度甲基化的SHOX2或RASSF1A不僅在16例外科手術(shù)標(biāo)本中被檢測(cè)到,而且在11例組織病理學(xué)陰性穿刺活檢中也被檢測(cè)到。顯示與病理結(jié)果相比,甲基化生物標(biāo)志物的敏感性更高,可顯著提高診斷效率[4]。

 

04

甲基化檢測(cè)應(yīng)用于肺癌早期診斷潛力巨大



 

目前,常規(guī)的病理診斷在很大程度上屬于“經(jīng)驗(yàn)科學(xué)”,主觀性很強(qiáng)。病理診斷(包括細(xì)胞和組織病理學(xué)檢查)可能會(huì)受到標(biāo)本質(zhì)量和病理學(xué)家診斷水平的嚴(yán)重影響。檢測(cè)的靈敏度和可重復(fù)性需要改進(jìn)和提高。新興的分子診斷方法更加敏感和客觀,可以克服形態(tài)學(xué)診斷的固有缺陷。DNA甲基化改變是癌癥早期診斷中最有前景的生物標(biāo)志物之一,已經(jīng)從科學(xué)研究轉(zhuǎn)移到臨床應(yīng)用。許多研究報(bào)道了多種DNA甲基化生物標(biāo)志物,并證實(shí)了其在肺癌診斷中的作用。RASSF1A和SHOX2甲基化的聯(lián)合檢測(cè),以其高靈敏度和特異性,可能為肺癌篩查和進(jìn)展監(jiān)測(cè)提供無(wú)與倫比的生物標(biāo)記物。通過(guò)研究進(jìn)一步了解RASSF1A和SHOX2的生物學(xué)功能,并改進(jìn)其檢測(cè)方法有助于其在臨床實(shí)踐中更好的發(fā)揮作用。這些標(biāo)志物的應(yīng)用有望提高肺癌患者篩查的準(zhǔn)確性,從而提高肺癌患者5年生存率,并及時(shí)指導(dǎo)臨床個(gè)體化用藥。


參考文獻(xiàn):

[1].早期肺癌診斷中國(guó)專家共識(shí) (2023年版)

[2].J Cancer Res Clin Oncol. 2020 Jun;146(6):1379-1393

[3]. Front Oncol. 2022 Jun 28;12:849024.

[4].Front Oncol. 2020 Dec 14;10:565780.


文章來(lái)源:甲基化

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