DNA甲基化檢測,不僅可用于早期疾病的篩查,還可用于確定個(gè)體對化療的反應(yīng),近年來獲得了腫瘤早篩行業(yè)越來越多的關(guān)注。那么DNA甲基化到底是什么?有什么用處呢?
循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA),屬于血液循環(huán)游離DNA(cell-free DNA,cfDNA)的一種,作為近年來腫瘤領(lǐng)域檢測的研究重點(diǎn),在腫瘤無創(chuàng)前期早篩中具有重要應(yīng)用價(jià)值。
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學(xué)修飾的一種形式,是指DNA分子在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的作用下將甲基選擇性地添加到特定堿基上的過程。DNA甲基化能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn),是最重要的表觀遺傳調(diào)控方式之一。
從DNA甲基化層面看,腫瘤細(xì)胞與正常細(xì)胞的區(qū)別主要是全基因組范圍低甲基化和特定序列CpG島異常高甲基化。低甲基化主要發(fā)生在原癌基因啟動(dòng)子區(qū)域和非編碼重復(fù)序列,這些序列的低甲基化會(huì)導(dǎo)致基因激活并破壞基因組穩(wěn)定性,引起細(xì)胞異常增殖,最終誘發(fā)腫瘤。
在特定基因區(qū)域中,ctDNA的異常甲基化具有較高的一致性,使得DNA甲基化檢測在腫瘤診斷、監(jiān)測、治療效果和預(yù)后判斷等方面比檢測腫瘤特異突變更為廣泛。所以,ctDNA甲基化檢測被認(rèn)為是最有價(jià)值的癌癥診斷和風(fēng)險(xiǎn)評估方法之一。
以宮頸癌為例,如果說其他針對宮頸癌的檢測方式都是從病毒或者宿主細(xì)胞層面進(jìn)行篩查及分流,那DNA甲基化就是從宿主基因?qū)用孢M(jìn)行分析檢測,從而預(yù)測罹患宮頸癌的風(fēng)險(xiǎn)。
作為新興的篩查分流方式,針對高危型HPV陽性或者細(xì)胞學(xué)≥ASCUS的患者,均可推薦宮頸癌DNA甲基化分子檢測。此外,宮頸癌DNA甲基化檢測的應(yīng)用范圍還包括防癌體檢、輔助診斷、癌前病變管理以及復(fù)發(fā)監(jiān)測。
DNA甲基化具有組織特異性,即不同腫瘤有一組特異性的DNA甲基化位點(diǎn),且甲基化檢測方便,靈敏度和特異性高。
生長發(fā)育基因、免疫調(diào)節(jié)基因、細(xì)胞分化與腫瘤發(fā)生相關(guān),不同的基因有著各自不同的功能。PAX和JAM基因在宮頸癌中表達(dá)高,CDO和ELF基因在子宮內(nèi)膜癌中表達(dá)高,S3ST和HOXA基因在卵巢癌中表達(dá)高。
基于三萬多例的臨床癌癥樣本大數(shù)據(jù)分析,證明身體出現(xiàn)可見的癌癥之前,血液中的DNA就已經(jīng)攜帶癌癥異常的甲基化信號,即癌癥細(xì)胞DNA會(huì)隨著癌癥細(xì)胞的內(nèi)吞、凋亡和分泌等生理過程進(jìn)入血液(即ctDNA)。
因此,基因甲基化檢測的臨床意義主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:第一是預(yù)測腫瘤發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)和腫瘤復(fù)發(fā)監(jiān)測;其二是輔助惡性腫瘤的診斷,尤其是交界性病變的診斷;第三,取材獲得檢查標(biāo)本便捷可行??傊?,甲基化檢測的臨床應(yīng)用將進(jìn)一步向治療隨訪、分層管理及早癌篩查方向邁進(jìn)。
DNA甲基化檢測適用于所有關(guān)注自身健康狀況的人群。
此外,有癌癥家族史的人群;長期熬夜、三餐不定、無規(guī)律作息;長期吸煙、重度飲酒;暴飲暴食,喜食高鹽、腌制、熏烤、油炸食品等生活習(xí)慣不良的人群;有呼吸道慢性病、消化道慢性病的人群;超過3年未進(jìn)行宮頸癌篩查或感染HPV病毒的女性;長期暴露在可致癌環(huán)境下的人群等尤其應(yīng)當(dāng)關(guān)注檢測結(jié)果。
雖然癌癥早篩目前對大眾來說還是一個(gè)比較新的概念,但是基于其獨(dú)特的優(yōu)越性,相信相關(guān)篩查將會(huì)在減少癌癥發(fā)病率以及死亡率方面做出巨大貢獻(xiàn)。