來自馬薩諸塞州總醫(yī)院(MGH)、布里格姆婦女醫(yī)院(BWH)、麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)布羅德研究所的一組研究人員開發(fā)了一種非侵入性基因檢測方法，可以篩查孕婦的血液，調(diào)查胎兒DNA序列變異的所有基因。研究小組通過檢查51名孕婦的血液樣本對該測試進(jìn)行了評估，發(fā)現(xiàn)該測試能夠捕獲從母親那里遺傳的變異，以及母親身上不存在的與產(chǎn)前診斷相關(guān)的新變異。他們的原理驗(yàn)證分析結(jié)果發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》上。
“我們的研究表明，使用血液測試來篩選胎兒基因組中的大多數(shù)基因是可行的，而不需要像羊膜穿刺術(shù)這樣的侵入性程序，”資深作者M(jìn)ichael E. Talkowski博士解釋說，他是MGH基因組醫(yī)學(xué)中心主任，哈佛醫(yī)學(xué)院(HMS)神經(jīng)病學(xué)副教授，也是Broad研究所的成員。
無創(chuàng)產(chǎn)前檢查(NIPT)，也被稱為產(chǎn)前無細(xì)胞dna篩查，允許孕婦接受血液檢查，以篩查胎兒染色體的非常大的變化，如21號染色體的額外拷貝，稱為唐氏綜合癥(21三體);染色體復(fù)制:其他染色體的整個副本的獲得或丟失;X和Y性染色體的存在和數(shù)量(表明胎兒的性別)，以及最近與某些胎兒狀況相關(guān)的少量變異。
然而，對于許多產(chǎn)前遺傳診斷，有必要確定基因組中蛋白質(zhì)編碼序列(即外顯子組)的單個核苷酸變化。目前，外顯子組篩查需要通過羊膜穿刺術(shù)等侵入性醫(yī)療程序進(jìn)行基因檢測，這不僅成本高昂，而且對母親和胎兒都有一定的內(nèi)在風(fēng)險。這項(xiàng)新開發(fā)的測試可以從母親血液中循環(huán)的DNA中發(fā)現(xiàn)和解釋胎兒外顯子組的變異。該方法被該團(tuán)隊(duì)稱為非侵入性胎兒測序(NIFS)。
這種高分辨率NIFS方法使研究小組能夠調(diào)查外顯子組，發(fā)現(xiàn)序列變化，并區(qū)分潛在的致病變異和可能從母親遺傳的良性變異。他們對51名懷孕婦女進(jìn)行了NIFS方法的測試，這些孕婦都是在馬薩諸塞州總醫(yī)院(Massachusetts General Hospital)和布萊根婦女醫(yī)院(Brigham and Women’s Hospital)接受護(hù)理的孕婦群體的代表，布萊根婦女醫(yī)院是麻省總醫(yī)院(Massachusetts General Brigham)醫(yī)療系統(tǒng)的創(chuàng)始成員。
NIFS篩查方法使用母體抽血，而不需要對母親或父親進(jìn)行單獨(dú)的基因檢測。研究小組發(fā)現(xiàn)，無論檢測到多少胎兒DNA，該方法對于發(fā)現(xiàn)胎兒基因組中存在的單堿基DNA變化和小的插入和缺失都非常敏感，而不是在母體基因組中存在。“在我們的回顧性分析中，我們能夠從NIFS方法中準(zhǔn)確地發(fā)現(xiàn)和預(yù)測胎兒序列變異，從原始數(shù)據(jù)中獲得>99%的靈敏度，使用我們的分析方法過濾后的靈敏度>90%，”MGH神經(jīng)內(nèi)科研究員、HMS助理教授哈里森·布蘭德博士說。
在接受現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)護(hù)理基因檢測的14例妊娠中，NIFS方法也進(jìn)行了評估，NIFS檢測到同一個體中侵入性檢測報告的所有臨床相關(guān)變異。
作者對51名孕婦進(jìn)行了初步測試，但研究結(jié)果表明，該測試可能適用于許多樣本。“這項(xiàng)研究的臨床意義可能是深遠(yuǎn)的，特別是對于那些從超聲波中懷疑胎兒異常并指示進(jìn)行侵入性檢查的妊娠，”共同資深作者凱瑟琳·格雷(Kathryn Gray)博士說，她是布里格姆婦女醫(yī)院的產(chǎn)科醫(yī)生和臨床遺傳學(xué)家，也是HMS婦產(chǎn)科的助理教授，目前是華盛頓大學(xué)的副教授。
“人們早就知道，胎兒序列變異可以從無細(xì)胞的胎兒DNA中獲得，外顯子組測序已經(jīng)是標(biāo)準(zhǔn)護(hù)理的一部分，但目前需要侵入性手術(shù)。”Talkowski補(bǔ)充說，他也是2015-2020年Desmond和Ann Heathwood MGH研究學(xué)者，“這些結(jié)果表明，非侵入性測序可能可以從胎兒外顯子組中獲取與標(biāo)準(zhǔn)護(hù)理中已經(jīng)獲得的相同的遺傳信息，但僅通過血液檢查而無需侵入性程序。”
該團(tuán)隊(duì)目前正在與其他研究人員合作，擴(kuò)大和驗(yàn)證這些發(fā)現(xiàn)，并進(jìn)一步開發(fā)這些方法。“我們的基準(zhǔn)測試表明，還有更多的優(yōu)化空間。
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2023-11） | 
