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小科普 | Simple Western 的橫空出世
[ 發(fā)布日期:2025-1-17 16:53:27    閱讀次數(shù):535 ]

WB 的發(fā)展歷程
長(zhǎng)期以來(lái),檢測(cè)和分析蛋白質(zhì)的能力一直是科學(xué)家們的關(guān)鍵追求。幾十年來(lái),對(duì)蛋白質(zhì)檢測(cè)準(zhǔn)確性和可靠性的追求促進(jìn)了一系列技術(shù)飛躍。從早期的凝膠電泳和 Western blotting 的發(fā)明到自動(dòng)化 Western 分析的發(fā)展,研究人員不斷突破蛋白質(zhì)分析工具的界限。
1807年,科學(xué)家首次觀察到在電場(chǎng)作用下,水中的粘土顆粒向正極移動(dòng)的現(xiàn)象,這一現(xiàn)象為電泳奠定了基礎(chǔ)。直到20世紀(jì)50年代,隨著淀粉和聚丙烯酰胺等電泳基質(zhì)的引入,研究人員才開(kāi)始使用凝膠電泳技術(shù)從復(fù)雜的混合物中分離蛋白質(zhì)1。然而,這些早期的電泳方法無(wú)法區(qū)分大小相似的蛋白質(zhì)。1970年,在醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室研究噬菌體T4的分子生物學(xué)家烏爾里希·萊姆利(Ulrich Laemmli)意識(shí)到,一種名為十二烷基硫酸鈉(SDS)的蛋白質(zhì)變性洗滌劑可以幫助根據(jù)分子量將多肽鏈分離出來(lái),因?yàn)樗鼈冊(cè)谀z中遷移時(shí)會(huì)發(fā)生這種變化。通過(guò)創(chuàng)建一種含有不同濃度SDS和聚丙烯酰胺的不連續(xù)雙層凝膠系統(tǒng),萊姆利能夠更清楚地觀察到蛋白質(zhì)條帶。這種方法現(xiàn)在被稱為SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),它使他能夠識(shí)別出構(gòu)成噬菌體T4衣殼的先前未知的蛋白質(zhì)2。與此同時(shí),其他研究人員正在使用凝膠電泳來(lái)分離 DNA 等生物分子。1975 年,愛(ài)丁堡大學(xué)的分子生物學(xué)家埃德溫·索恩(Edwin Southern)通過(guò)從電泳分離的片段中檢測(cè)特定 DNA 序列,將這項(xiàng)技術(shù)向前推進(jìn)了一步。為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),他引入了一個(gè)新步驟:印跡。在瓊脂糖凝膠上分離 DNA 片段后,他將它們轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,從而捕獲 DNA3。然后,他使用可以與特定 DNA 序列結(jié)合的放射性 RNA 探針,并通過(guò)放射自顯影法檢測(cè)它們。索恩以自己的名字將這項(xiàng)發(fā)明命名為 Southern blotting。
隨著Southern blotting成為分析DNA樣本的流行工具,它也激發(fā)了研究人員探索其在其他應(yīng)用中的潛力。1977年,斯坦福大學(xué)的生化學(xué)家喬治·斯塔克(George Stark)和他的同事們通過(guò)使用一種名為重氮芐氧甲基(DBM)紙的化學(xué)改性纖維素作為轉(zhuǎn)移RNA分子的介質(zhì),引入了一種RNA印跡法4。他們將這種創(chuàng)新命名為“Northern blotting”,以反映其與Southern blot的聯(lián)系。在成功之后,斯塔克的團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步將印跡法應(yīng)用于蛋白質(zhì)分析,并于1979年7月發(fā)表了他們的方法。他們對(duì)萊姆利的不連續(xù)凝膠系統(tǒng)進(jìn)行了修改,通過(guò)將聚丙烯酰胺/瓊脂糖凝膠混合物加入細(xì)胞裂解液中來(lái)分離蛋白質(zhì)。用于蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移時(shí),他們使用了DBM紙,并使用放射性蛋白質(zhì)來(lái)探測(cè)靶蛋白。使用該方法,該小組成功地鑒定了感染猴痘病毒的腫瘤抗原5。
與此同時(shí),世界另一端的兩位生物化學(xué)家,弗里德里希·米歇爾研究所的哈里·托賓 (Harry Towbin) 和弗雷德·哈奇癌癥中心的尼爾·伯內(nèi)特 (Neal Burnette) 正在獨(dú)立開(kāi)發(fā)一種類似的蛋白質(zhì)印跡方法。兩個(gè)團(tuán)隊(duì)都建立了一種電泳印跡程序來(lái)轉(zhuǎn)移蛋白質(zhì),其中包括使用電場(chǎng)將蛋白質(zhì)從電泳凝膠驅(qū)動(dòng)到硝酸纖維素膜上。哈里·托賓利用一抗結(jié)合靶蛋白,然后使用放射性或熒光標(biāo)記的二抗檢測(cè)一抗。尼爾·伯內(nèi)特的蛋白質(zhì)檢測(cè)方法略有不同——他使用了一抗和二抗放射性標(biāo)記蛋白。哈里·托賓在1979年發(fā)表了他的方法,比斯塔克的論文發(fā)表晚了兩個(gè)月,而伯內(nèi)特的手稿是在同一時(shí)期準(zhǔn)備的,但最初被拒絕。1981年,伯內(nèi)特的論文被同一本雜志接受,他將這種方法稱為 Western blotting6.
蛋白質(zhì)印跡很快引起了全世界研究人員的注意。在它誕生后的頭十年里,它成為了檢測(cè)與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)的關(guān)鍵診斷工具。一些研究人員將WB應(yīng)用于血液樣本中HIV抗體的識(shí)別7,而另一些人則用它來(lái)檢測(cè)由錯(cuò)誤折疊的朊蛋白引起的克雅氏病8。在此期間,技術(shù)進(jìn)步使 Western 印跡更容易獲得。研究人員引入了新的膜材料,例如聚偏二氟乙烯和尼龍,以改進(jìn)印跡過(guò)程。這些材料耐用、穩(wěn)定,可以更有效地結(jié)合蛋白質(zhì)。檢測(cè)方法也發(fā)生了變化?;瘜W(xué)發(fā)光法(使用與酶聯(lián)次級(jí)抗體反應(yīng)后發(fā)出光的化學(xué)發(fā)光底物)取代放射性方法,成為更受歡迎的用于觀察蛋白質(zhì)條帶的方法。
Simple Western 的橫空出世
盡管有這些改進(jìn),但對(duì)于進(jìn)行 Western blotting實(shí)驗(yàn)的研究人員來(lái)說(shuō),該技術(shù)也有一定的局限性。Western blot方法的實(shí)驗(yàn)步驟較多,操作較為復(fù)雜且耗時(shí)較長(zhǎng),并且該技術(shù)對(duì)實(shí)驗(yàn)條件要求較高,如電泳分離不充分、轉(zhuǎn)印不完全、封閉不足或抗體特異性差等都會(huì)影響最終的結(jié)果。此外,該技術(shù)無(wú)法完成對(duì)蛋白質(zhì)的絕對(duì)定量,對(duì)于低豐度蛋白也很難很難檢測(cè)到清晰準(zhǔn)確的條帶。且傳統(tǒng) Western blot的低通量性難以滿足大規(guī)模篩選、組學(xué)研究等對(duì)多樣本、多蛋白同時(shí)分析的需求。
為了解決傳統(tǒng) Western blot的局限性,2011 年,ProteinSimple 團(tuán)隊(duì)在人類蛋白質(zhì)組組織年度世界大會(huì)上推出了第一臺(tái)基于毛細(xì)管的自動(dòng)化 Simple Western 儀器 Simon™ 系統(tǒng)。相對(duì)于傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)印跡來(lái)說(shuō),Simon™顯著提高了蛋白質(zhì)分析的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。2014 年,ProteinSimple (于2014年被Bio-Techne收購(gòu))推出了 Wes™ 系統(tǒng),它可在 3 小時(shí)內(nèi)處理多達(dá) 25 個(gè)樣品,靈敏度是 Simon™的 10 倍。
為了滿足客戶的需求,Bio-Techne在2018年推出了 Jess™ 系統(tǒng),它具有化學(xué)發(fā)光和熒光雙重檢測(cè)功能,使用戶能夠檢測(cè)樣品中的更多靶標(biāo)。并且 Jess™ 系統(tǒng)還集成了內(nèi)置的總蛋白測(cè)量功能,以便更輕松地進(jìn)行數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化。此外,Bio-Techne還開(kāi)發(fā)了一種創(chuàng)新的 RePlex™ 檢測(cè)試劑盒,該檢測(cè)試劑盒模擬了傳統(tǒng)蛋白質(zhì)印跡中的剝離和重新檢測(cè)步驟,但在同一毛細(xì)管內(nèi),使研究人員能夠從每個(gè)樣品中提取更多數(shù)據(jù)。Simon™、Wes™ 和 Jess™ 的成功只會(huì)推動(dòng) Bio-Techne進(jìn)行更多創(chuàng)新。
此后,Bio-Techne一直致力于擴(kuò)展 Simple Western 的能力,以更好地支持不同的研究需求。例如,2021年推出的 Abby™ 系統(tǒng)為尋求自動(dòng)化 Western 印跡工作流程的研究人員提供了一種易于訪問(wèn)、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的解決方案。
2024年,Bio-Techne隆重推出 Simple Western 家族的最新成員:Leo™系統(tǒng)。Leo™ 一次運(yùn)行可處理多達(dá) 100 個(gè)樣品,并僅需 3 小時(shí)即可提供結(jié)果,顯著提高了通量,使其成為藥物篩選和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)等大規(guī)模研究的理想選擇。其擴(kuò)展的多重檢測(cè)功能允許每個(gè)樣品檢測(cè)多達(dá) 8 個(gè)蛋白質(zhì)靶標(biāo),為研究人員提供來(lái)自單個(gè)實(shí)驗(yàn)的更全面的數(shù)據(jù)。這些功能使 Leo™ 成為支持各種研究領(lǐng)域和藥物開(kāi)發(fā)階段的多功能工具。
 

型號(hào)對(duì)比






參考文獻(xiàn)
1. Sule, R., Rivera, G. & Gomes, A. V. Western Blotting (immunoblotting): History, Theory, Uses, Protocol and Problems. BioTechniques 75, 99–114 (2023).
2. Laemmli, U. K. Cleavage of Structural Proteins during the Assembly of the Head of Bacteriophage T4. Nature 227, 680–685 (1970).
3. Southern, E. M. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J. Mol. Biol. 98, 503–517 (1975).
4. Alwine, J. C., Kemp, D. J. & Stark, G. R. Method for detection of specific RNAs in agarose gels by transfer to diazobenzyloxymethyl-paper and hybridization with DNA probes. Proc. Natl. Acad. Sci. 74, 5350–5354 (1977).
5. Renart, J., Reiser, J. & Stark, G. R. Transfer of proteins from gels to diazobenzyloxymethyl-paper and detection with antisera: a method for studying antibody specificity and antigen structure. Proc. Natl. Acad. Sci. 76, 3116–3120 (1979).
6. Burnette, W. N. “Western Blotting”: Electrophoretic transfer of proteins from sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gels to unmodified nitrocellulose and radiographic detection with antibody and radioiodinated protein A. Anal. Biochem. 112, 195–203 (1981).
7. Esteban, JuanI. et al. IMPORTANCE OF WESTERN BLOT ANALYSIS IN PREDICTING INFECTIVITY OF ANTI-HTLV-III/LAV POSITIVE BLOOD. The Lancet 326, 1083–1086 (1985).
8. Brown, P. et al. Diagnosis of Creutzfeldt-Jakob Disease by Western Blot Identification of Marker Protein in Human Brain Tissue. N. Engl. J. Med. 314, 547–551 (1986).
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